在全国人民抗击非典型肺炎的斗争中，九三学社各级组织和广大成员按照中共中央、国务院的统一部署，发挥自身特点和优势，切实履行参政党职能，积极为抗击“非典”建言献策。全国人大常委会副委员长、九三学社中央主席韩启德在深入一线调查研究的基础上，先后在温家宝总理主持的国务院工作座谈会、中央统战部召开的民主党派工商联负责人座谈会和全国人大常委会上，就防治非典型肺炎工作提出建议。他写信给吴邦国委员长呼吁防治“非典”工作要依法办事，还多次与国务院副总理吴仪、中共北京市委书记刘淇、北京市代市长王岐山、教育部部长周济就防治“非典”工作交流看法，提出建议。
韩启德就防治“非典”工作提出的主要建议是：
一、加大力度割断传染源。对疫情严重区域要果断宣布疫区，实施彻底隔离。严格控制流动人口。在北京市郊区扩大定点医院，以保证市内非定点医院的“非典”病人迅速转移，防止这些医院成为疫区和传染源；在郊区设立更多与“非典”病人密切接触人群的隔离场所和一线医护人员撤换休整的隔离场所。
二、严格执行与用好《中华人民共和国传染病防治法》。防治“非典”要依法办事。过去防治工作中出现的一些问题不少都是因为没有执行好这个法。建议大力加强《传染病防治法》的宣传，在宣布政府决策时，要说明法律依据。
三、更加广泛深入地发动群众。发动群众是我国的强项，也是社会主义制度优越性的充分体现。建议要将工作发动到最基层，包括街道居委会、单位中的每个最小组织单元。宣传工作要结合群众思想实际，解除群众的恐慌心理。
四、加强科技联合攻关。科技、高校、卫生等各个系统的科技力量要广泛、迅速地联合起来。各部门各单位要摒弃部门利益，顾全大局，集中攻关。目前最重要的是发展检测带病毒者的技术，以早期发现病人，早期隔离治疗。
五、进一步加强领导。在现在这样的非常时期，要实行强势领导。各级领导要职责明确，如在职责范围内发生重大失职行为，应就地免职。
韩启德的建议受到中共中央、国务院和北京市委、市政府的高度重视，许多建议被采纳。
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