上世纪90年代，国家有关部门审时度势，高瞻远瞩，决定在中国农业大学设立化学和生物学理科基础科学研究与教学人才培养基地，并给基地以强有力的基金资助。基地的设立不但改善了教学条件，提高了教学质量，而且对相关专业的招生、分配都产生了积极的促进作用。
化学与农业现代化息息相关。为了实现农业的稳产、高产，必须用新的科学技术改变农业的传统耕作模式，当前我国正在普遍推广的设施农业，作物化控技术，种子包衣，组织培养，无土栽培等技术都离不开化学的支撑。而农业上广泛使用的杀虫剂、杀菌剂、植物生长调节剂、饲料添加剂等更直接来源于化学。化学理科基地的设立为培养更多的具有农学背景的优秀化学理论基础人才作出了贡献。
中国农业大学校务委员会于2001年1月在应用化学系、基础化学系、中心实验室等单位的基础上，组建应用化学学院。培养目标为：具有一定的农学、生物学知识及宽厚的化学理论知识与技能，较强的科研和创新能力，能够适应现代化、特别是农业现代化需要的高层次教学、科研及管理专门人才。基地用现代的观点选择和组织传统的内容，对经典内容采用粗线条讲解，适当地为学生打开化学前沿的窗口，使学生产生新鲜感，提高学习兴趣。为使学生创新能力的培养更加系统化和科学化，在学校党委的支持下，由党总支牵头，部分教师参加的“大学生创新意识和创新能力培养”的研究项目已经正式启动。
通过多方努力，基地班的学生素质普遍提高。1997级本科生是第一届化学理科基地班的学生，该班的英语四级通过率位于全校的前列，1999年被评为北京市先进班集体。在2000年举办的全国化学理科基地实验技能竞赛中，我校基地班学生取得了优异成绩。
化学理科基地为全校开设了数十门化学类和农药学类的课程，把基地建设和教学改革的成果奉献给了全校；基地教学条件的改善和教学质量的提高，为提高和改善全校化学基础课教学创造了条件；在国内产生了一定影响，如华中师范大学农药化学研究所和山东农业大学应用化学系等兄弟院校与我们联系，要求共同商讨相应的教学计划；通过师资培训将基地的办学影响辐射到全国，已为兄弟院校定向培养在职申请学位教师10余人。
生物学国家理科基地是以中国农业大学生物学院为依托建立的。作为理科性质的学院，中国农业大学生物学院始建于1984年，现设有植物科学系、动物学及动物生理学系、微生物学系和生物化学与分子生物学系；拥有4个国家级重点学科；还拥有“农业生物技术”和“植物生理学与生物化学”两个国家重点开放实验室。生物学院师资力量雄厚，现有教授26人（其中中科院院士3名），副教授29名。有硕士授权点5个，博士授权点4个和博士后流动站；同时还有国务院学位委员会批准的生物学一级学科博士学位授权点。
自生物学基地成立以来，生物学院承担了“国家重点基础研究规划973项目”、国家科技部863项目、国家基金委重点、重大项目及国家杰出青年基金项目等200余项；仅2000、2001两年科研经费实际到位达3512万元。1997至2001年间，生物学院荣获部级科技进步一等奖3项，国家自然科学二等奖1项，北京市科技进步奖1项等。陈文新教授还被增选为中国科学院院士。
生物学院由于基地建设基金的投入和师资队伍的进一步建设，使得生物学基地在专业调整、课程设置、教材建设、实验室建设等方面的工作均走在全校前列，为全校教学工作的全面建设发展起到了示范带头作用。基地建设内容之一的各主要课程新教材的编写，也对全国各类院校相关课程的教学内容改进与更新起到积极推动作用。
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