2005年12月21日，《北京大学学报（自然科学版）》创刊50周年暨首届“学报贡献奖”颁奖典礼在北京大学举行。《北京大学学报（自然科学版）》1955年12月创刊，半个世纪以来，学报在一代代学人的精心呵护下，始终保持了较高的学术水平。自出版以来至今，周光召、徐光宪、廖山涛等大批院士都担任过学报的编委或在学报上发表
过文章。截至2005年11月，中科院和工程院院士在学报上发表文章的共计63人。1995年以来，学报共获得国家级和部委级奖励8次。学报的发展历程从一个侧面向国内外展示了北京大学的科研成果。与会的学者和嘉宾对此给予了高度评价，并对未来学报建设谈了建议和想法。
