咳嗽是人体的一种保护性反射，其目的是将进入气管内的异物排出体外。冬天天气寒冷，气候干燥，如果人们在慢跑时呼吸方法不正确，如张开嘴呼吸、边跑边说话等，不注意保温，或准备活动做得不充分等，都会引起咳嗽。
人体在正常情况下，呼吸是由呼吸门户——鼻腔进行的。鼻腔内血管十分丰富，有湿润空气的作用。如果人们在慢跑时呼吸方法正确，那么，冷空气进入鼻腔，经过加温而到达气管、肺泡时已接近体温；相反，不是用鼻子而是张开嘴巴呼吸，那么，冷空气长驱直进，使人体受到刺激，就会咳嗽。此外，还会引起呼吸道粘膜分泌粘液增加，出现多痰的现象。这些情况对于初练长跑的人来说，会暂时短期出现；随着跑步时间逐渐增长，跑步者纠正了张开嘴巴呼吸的错误，改用鼻或微张嘴巴（用舌尖顶住上前腭）呼吸，那么，这种现象就不会出现了。
除此之外，如果在寒冷天气慢跑前突然脱掉衣服，没有注意保温，也会因突然受寒冷刺激而引起反射性的咳嗽；在慢跑前没有好好地做准备活动，机体内各器官一时未能适应，就会引起心跳气短和短时间的呛咳；天气过冷及风速太大时，迎风而跑亦会发生呛咳。因此，人们只要充分做好准备活动及顺风而跑，呛咳是可以避免的。
总的来说，只要锻炼方法正确，持之以恒，随着身体素质的提高，长跑中一时出现的咳嗽现象是会逐步消失的。
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