目前，治疗由病原微生物感染所致炎症的主要武器仍是抗生素，只要明确引起炎症的病原菌，有针对性地选用合适的抗生素，便能使感染性炎症迅速消退而痊愈。
但是，倘若对非病原菌感染而致的“无菌性炎症”也采用抗生素治疗，那么，不但无益反而有害。因为人体内存在着一些正常有益的菌群，这些菌群有互相制约的作用，所以才能保持体内的微生态平衡，以防某一种细菌繁殖生长过盛而发生疾病。如果用抗生素治疗无菌性炎症，这些药物进入人体后将会敌我不分，乱杀无辜，反而压抑或杀灭了人体内有益的菌群，引起菌群失调，造成抵抗力下降，招致其他疾病的发生。例如，下述炎症若没有继发细菌感染，就不宜用抗生素治疗。
日常生活中经常发生的软组织损伤是一种无菌性炎症，其局部组织的瘀血、青紫、红肿、疼痛等现象大多是由于肢体扭伤、碰撞等原因使皮肤、肌肉、血管、淋巴和细小的神经纤维受到挫伤或发生断裂，血液和淋巴液、组织液从血管、淋巴管中渗出，积聚在损伤处，形成水肿、血肿的局部红肿、疼痛等炎症反应。
此种炎症用抗生素治疗无济于事，而应在早期做局部冷敷等物理治疗，并应减少活动，以减少渗出，待2－3天后进入渗出吸收期时，再用热敷的方法，以促进渗出的血液、淋巴液和组织液的吸收，才能消除软组织肿胀等炎症反应。
过敏反应也是引起无菌性炎症的一种原因。这种原因引起的疾病虽然都有一个“炎”的名字，但并不是由病原微生物感染而致病的。如果应用抗生素治疗，不但不起作用，反而可能因为新的药物过敏反应而加重原有的炎症。
过敏反应性炎症最容易表现在皮肤上，如接触性皮炎、药物性皮炎等。其发生的原因大多是过敏体质的人接触某一种致敏物质或使用某一种药物后，刺激机体产生组织胺之类的物质，这类物质和皮肤的H1受体结合后能引起皮肤的毛细血管扩张、通透性增强、血浆渗出，从而出现皮肤的炎症反应。此种炎症应该使用抗组织胺药物或皮质激素类药物治疗才能取得良效。
寒冷季节里发生的冻疮，常常是由于寒冷的刺激这一物理因素致使皮肤的毛细血管发生痉挛收缩，引起皮肤血液循环障碍而发生的皮肤局部的无菌性炎症。这种炎症用抗生素治疗往往无效，而应该采取局部保暖、应用扩张血管的药物、改善皮肤血液循环的方法治疗，才能使炎症消退。
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