自国土资源部明示“小产权房不合法”和建设部发出“风险提示”后，不少地方政府纷纷出台了小产权房清理办法，但实践中遇到重重阻力。
南京市规定：凡是符合城市整体规划和土地用途规划的小产权房项目，经补办手续后可以领取产权证与土地证。遗憾的是，目前南京市尚没有一个小产权房项目补办“两证”。
“房地产涉及农村和城镇两个市场，过去没有城乡人员流动，两个市场截然分开。”北京师范大学房地产研究中心主任董藩说，如果有一天农村土地可以进入城市流通，户籍界限也被打破，就无所谓小产权房、大产权房，但在目前，开发小产权房是违法，购买也是违法。
江苏省社科院院长宋林飞认为：“小产权房大规模出现，已经成为房地产市场的怪胎。使国家减少了大量土地出让金收益，是国有资产的巨大流失，还威胁到耕地保护红线，也暴露出城乡土地二元管理的巨大漏洞。”
专家指出，叫停小产权房只是个暂时办法，问题的根源还在于引导消费者回归大产权房的合法轨道上来。比如加大经济适用房、廉租房等具有保障性用房的供应，进一步促进土地制度的改革等。(《北京日报》9.28邓华宁胡梅娟文)
