我国有鲸豚类动物40余种，其中白鳍豚和中华白海豚是国家一级重点保护野生动物，其余均为国家二级重点保护野生动物。生活在我国长江中下游的白鳍豚，是地球上仅存的4种淡水豚之一，是我国特有的珍稀水生哺乳动物，享有“长江女神”之美誉，在仿生学和医学研究等方面有着重要的价值。
据预测，目前我国长江白鳍豚现存不足100头，长江江豚约1000－2000头，中华白海豚也仅有1000头左右。专家预言，如果不采取非常的保护措施，白鳍豚将有可能在20年后从长江、从地球上永远消失。
去年新修订的《渔业法》专门增加了对白鳍豚等珍贵、濒危水生野生动物实行重点保护的条款。但是随着国民经济的发展和人类活动的影响，鲸豚保护亟待解决的问题仍然很多。
首先是鲸豚生存环境不断恶化。由于建闸筑坝、污染、船舶航运和渔业资源衰退等原因，鲸豚类的栖息环境发生了很大变化，鲸豚的生存受到了严重威胁。目前，鲸豚的濒危程度都高于国宝大熊猫。
其次，虽然《野生动物保护法》已颁布多年，但在实践中，一些主管部门对野生动物保护的重要性和必要性认识不足，缺乏紧迫感，部分群众保护鲸豚的意识尚待提高。
鲸豚研究滞后，经费不足。和其他水生野生动物一样，鲸豚保护是一项技术性强的工作，保护这些物种有其特殊性，鲸豚数量稀少、捕获困难、驯养繁殖技术很不完善。而要进行科学和有效的管理，必须建立在对鲸豚的生态习性、资源分布以及环境变化等全面了解的基础上。但是，国家用于水生野生动物保护的经费有限，许多地方政府也没有相关项目的财政预算，这就使得鲸豚保护工作举步维艰。
但是，一些保护区同时存在着人员、经费不足，保护职责不明确等问题。对此，有关专家建议，应采取一系列有力措施加强长江鲸豚类保护区建设。
一是调整鲸豚保护的力量，选拔懂生态、生物方面的专业人员和懂法律的管理人员充实到鲸豚保护一线。
二是加强长江鲸豚类保护区管理的基础工作，组建专门班子，对鲸豚保护、鱼类等物种、植被和保护区水文、地质、地貌、水质污染、船舶航行、人类活动等方面的情况进行深入调查与监测，以便为制定保护措施提供可靠的依据；在白鳍豚、江豚活动频繁区域设立观察哨塔，随时掌握白鳍豚、江豚活动情况；对污染排放量大的临湘农药厂、洪湖化工总厂以及在建的河道整治工程进行重点监督，以便采取对应措施。
三是进一步加强长江鲸豚类保护区的法制建设。建议国家农业部会同国家环保总局和湖北省人民政府落实长江新螺段白鳍豚自然保护区的划界、保护、建设、管理等工作，授予保护区管理处对全江段统一管理的权力，同时制定一个便于操作的《白鳍豚保护区管理办法》，明确职责，减少磨擦。在长江中下游实行禁渔期、禁渔区，以促进对白鳍豚、江豚及长江渔业资源的保护。
四是建议国家有关部门增加追补投资计划，解决长江鲸豚类保护区目前资金短缺的实际困难，解决保护区监测设备及相关经费。
