课程改革是一个复杂的过程，在改革过程中不可避免的会出现各种各样的问题。为考察新课程实施的具体情况，教育部派考察组对第一批实验区进行了实验评估，发现目前课程实验中存在的突出问题表现在以下几个方面。
缺乏实验经费与课程资源是目前课程实施遇到的一个最大的障碍。在此次调查的学校中，尽管各个试验区、学校之间的条件有很大的差异，但教育行政管理人员、教师、校长普遍感到突出的问题就是经费不足，材料、设备缺乏。由此带来一系列的问题。例如，学校无法改善教学的设备、设施；教师没有更多的机会提高自己的业务素质；校舍、师资的限制使班额过大，
教师培训是有效实施新课程的基本保证。虽然多种形式的教师培训对于课程实验的启动和前期实验工作的顺利开展发挥了重要的作用，但随着课程实验的推进，教师们感到更需要具体的、实用性强的培训。另外，从培训的形式看，除了讲授式、报告或讲座式之外，教师更渴望一种探究式的学习，案例分析式的培训。
要落实课程改革的各项措施，就必然要有与之相配合的评价制度与评价方法。社会与上级教育行政部门如何评价学校，学校如何评价教师，教师如何评价学生，都从一定程度上制约着课程措施落实的程度。目前实验区的校长、教师、家长最担心的是：按照新课程的教材和培养模式，我们的孩子能不能在全国统一命题的高考中与非实验区的学生抗衡。
从实验的初期效果看，的确取得了一定的成效，但对改革的前景却不能盲目乐观。不应该忽视这样几个事实：首批国家38个实验区、实验校乃至实验教师都是经过精心选择的，保证了实验人员内部的需求与动力；高质量的国家级、省级培训，保证了实验人员的素质；课程专家的指导，保证了教师困难的及时解决。当实验大面积推广后，就很难从人力、物力、财力等各方面满足这些条件，不可避免的会出现新的问题。因此，无论是课程设计者还是实施者，都应当充分认识新课程实施的复杂性，清醒地分析实施过程中存在的问题，采取恰当的策略，使新课程实施成功。
根据以上对课程实施成效和问题的分析，我们认为在进一步推进课程改革的过程中，应该注意以下几个问题。
一些实验区在实验过程中，邀请大学基础教育课程研究中心的专家、制定学科课程标准的专家讲学和指导。同时，发挥教研员、校长和教师的作用，共同学习、共同研究，随时发现问题，解决问题。这种推进课程实施的策略是有效的，也是必须的。随着实施范围的扩大，将有更多的学校进行实验，更要坚持多方人员参与，共同开展实验工作，形成学校课程开发与实施的一种新的文化，促进整个课程改革的发展。
如果制订政策时没有考虑实施政策所需要的资源，而且如果没有必要的资源，学校、教师和学生就会处于要求得不到满足的困境。这种局面会严重阻碍课程实施的进程。在课程改革的初期，课程实施所需要的空间、材料、设备、设施、环境、场地等课程资源，都应该加以规划，并且能够保障提供。这是改革初期重要的保障，也是改革得以推行的物质基础。
在调查中发现，有74.2％的教师认为，对自己最有收获的培训方式是“有指导性的讨论和研讨”。因此，今后的培训工作，应该将教师作为学习的主体，辅之以讲座、报告、讲授、阅读，使之在发现问题、思考问题和解决问题的过程中成长。因此，在今后的培训工作中，应该针对教师的学科、年龄、教龄、学历层次、所在地区等不同的个人条件与需要，开展针对性强的培训。
新课程改革从基本理念、课程设置、课程管理、教学与评价等各个方面都发生了重大的改变，从第一批27个省市自治区的38个实验区的初期实施效果看，取得了初步的进展，同时也存在很多问题。例如，课堂教学中，虽然整体上看，课堂气氛比较活跃，但很多教师反映，只是少部分学生活跃，还有很多学生没有真正参与到教学中；教师在使用新教材、尝试新的教学方式的过程中，缺乏相应的课程资源支撑。因此，应该为实验提供充分的时间，不能急于求成，在指导、评估的过程中，真正本着“先实验后推广”的原则，稳步推进实验研究。
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