1998年，医学遗传学国家重点实验室克隆出遗传性神经性高频性耳聋疾病相关基因，实现了在我国本土克隆遗传病致病基因零的突破；
2001年，分子生物学国家重点实验室在国际上发现了第一个与男性生殖系统炎症相关的功能基因，该成果发表在《科学》（《Science》）杂志上，这是我国生命科学基础研究成果首次在这一国际权威的杂志上发表……
科技部有关人士介绍说，重点实验室计划自1984年实施以来，承担并完成了大量国家重大基础研究、应用基础研究任务，并取得了一批突破性的重大科技成果，为国民经济建设和社会发展提供了强有力的技术支撑和知识背景，正成为我国组织高水平基础研究和应用基础研究、聚集和培养优秀科学家、开展学术交流的重要基地。
据了解，目前国家重点实验室共有163家，承担并完成了国家大量的科研项目。从事基础研究的国家重点实验室注重学科前沿的探索和多学科交叉渗透，突出创新，积极参与国际竞争，某些研究工作已在国际上占有一席之地：南京大学的固体微结构物理国家重点实验室通过对离子型声子晶体光学性质的研究，首次揭示了超晶格与电磁场相互作用的物理效应，开拓了声子晶体研究的新领域，有关工作在国际权威刊物上受到称赞；黄土与第四纪地质国家重点实验室瞄准全球变化研究的国际前沿和生态环境建设面临的重大问题，从东亚季风环境整体系统综合集成的高度开展多学科交叉的创新性研究，取得一系列重要成果……
以应用基础研究为主的实验室，紧密围绕国家目标，着眼于国家需求，为国民经济、社会发展和国防建设解决重大基础性、关键性技术难题，并努力形成自主的知识产权和创新体系，也取得了许多实用性的应用成果：
作物遗传改良国家重点实验室研制的高产优质油菜新品种华油杂3号、4号与华协1号，多抗优质特性的水稻改良型汕优63等，在生产上已得到大面积推广应用；新药研究国家重点实验室在早老性痴呆相关生物靶分子的研究方面取得了新进展，引起了很大的反响；声场声信息国家重点实验室提出了具有自主知识产权的水下远程被动定位新方法，并取得了国际上有独创性的重大成果，为国防建设提供了关键设备……
在人才培养方面，国家重点实验室已成为我国吸引、稳定、培养优秀人才的重要基地。具有较高素质、知识结构和年龄结构合理的研究群体目前正逐步在各个国家重点实验室形成。国家重点实验室在青年科技人才的培养方面，更是发挥了重要作用，为我国科技的可持续发展奠定了良好的人才基础。仅1999年度，国家重点实验室就培养博士4920人、博士后595人，硕士生6182人，同时，吸引和稳定了大批优秀中青年人才，仅客座人员就达14379人，外籍客座研究员607人。
